2002年贵州财经学院进行院系调整，撤销了投资系，除部分教师调整到会计系创办财务管理专业外，在投资系原有办学力量基础上成立了管理科学系，有“管理科学”、“工程管理”、“农村区域管理”等三个专业。2005年学校又在管理科学系的基础上成立管理科学学院，保留原有的“管理科学”、“工程管理”专业，还重新开办了“房地产经营管理”本科专业并于当年开始招生。2013年房地产经营管理专业改名为“房地产开发与管理”专业。

到目前为止，工程管理系包含三个专业：工程管理、工程造价、房地产开发与管理。其中，工程管理专业是国家重点学科。工程管理系设有房地产研究院，具有一支良好的研究团队。

在国际合作交流方面，现有ISEC工程管理专业；中外合作办学——房地产市场营销专业。